Hospedar site em servidor Linux ou Windows?
Logo após a decisão de publicar um site, blog ou qualquer outro tipo de página na internet, é fundamental decidir os aspectos técnicos sobre o projeto, e um dos primeiros pontos é escolher a hospedagem mais adequada.
Ao visitar a página de uma empresa de hospedagem, pode surgir a dúvida entre escolher um servidor rodando Windows ou rodando Linux.
Se a pessoa que deseja criar seu site não tiver o mínimo de experiência com hospedagem de sites, pode cai no erro de achar que o Windows é melhor devido à facilidade de uso do computador que tem casa. Isso é um erro pois são sistemas diferentes.
PORQUE ESCOLHER SERVIDOR LINUX
Os servidores Linux são os mais populares, costumam ser mais baratos e a depender de suas configurações e principalmente do seu gerenciamento são servidores extremamente estáveis, seguros e com excelente desempenho.
As mais diversas distribuições Linux são usadas em servidores de hospedagem, a exemplo da CentOS, Ubuntu, Debian , MEPIS e a Red Hat, por exemplo. Servidores Linux são indicados para linguagens de programação como PHP, CGI, Perl, Python e muitas outras.
Por ser um sistema operacional Open Source, ou seja, grátis, as empresas de hospedagem tem um custo a menos para repassar para os clientes, o que resulta em serviços mais baratos que os praticados em hospedagens Windows.
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Os melhores CMS (Content Management System) existentes são escritos em PHP, linguagem de programação nativa do ambiente Linux. Sistemas desenvolvidos em PHP também podem rodar em servidores Windows, mas seu desempenho é superior em sistemas Linux.
É muito mais fácil achar material de estudo, fóruns de desenvolvedores, scripts prontos e dicas na internet sobre sistemas desenvolvidos para servidores Linux . Se o sistema operacional é grátis, é muito mais fácil encontrar gente empenhada em disponibilizar material gratuito do que para um sistema que é pago.

A Hostgator, por exemplo, utiliza servidores Linux em seus planos de hospedagem compartilhada e nos VPSs, disponibiliza servidores Windows apenas em planos de servidores dedicados, haja vista a especificidade desta escolha.
PORQUE ESCOLHER SERVIDOR WINDOWS
Servidores Windows são necessários para rodar aplicações criadas em ASP, .Net, Access, Microsoft Exchange e SQL Server, por exemplo, que são tecnologias desenvolvidas pela Microsoft. Eles podem rodar também PHP, mas fazendo alguns ajustes, o que não é o ideal.
O principal motivo para escolher uma hospedagem Windows é ter um sistema desenvolvido em uma das linguagens nativas do ambiente Windows. E a escolha de uma delas vai depender de características muito específicas do seu projeto.
Conclusão
De maneira geral, a escolha mais comum é optar por uma Hospedagem Linux, que por se tratar de um sistema gratuito, torna o serviço mais barato, além de possuir mais sistemas gratuitos, desenvolvedores e colaboradores empenhados em promover o desenvolvimento de tecnologias e sistemas. A hospedagem Windows é indicada para casos específicos, em que as tecnologias empregadas no projetos assim exijam.